MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium tetani 12124569

Total Repeats: 1387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022778	TAA	2	6	183	188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606927
2	NC_022778	GAT	2	6	196	201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557606927
3	NC_022778	AG	3	6	210	215	50 %	0 %	50 %	0 %	557606927
4	NC_022778	AAT	2	6	229	234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606927
5	NC_022778	T	7	7	275	281	0 %	100 %	0 %	0 %	557606927
6	NC_022778	T	6	6	304	309	0 %	100 %	0 %	0 %	557606927
7	NC_022778	ATG	2	6	310	315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557606927
8	NC_022778	T	6	6	354	359	0 %	100 %	0 %	0 %	557606927
9	NC_022778	ATC	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557606927
10	NC_022778	A	6	6	435	440	100 %	0 %	0 %	0 %	557606927
11	NC_022778	AAC	2	6	573	578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557606927
12	NC_022778	A	6	6	633	638	100 %	0 %	0 %	0 %	557606927
13	NC_022778	AAGA	3	12	642	653	75 %	0 %	25 %	0 %	557606927
14	NC_022778	A	6	6	763	768	100 %	0 %	0 %	0 %	557606928
15	NC_022778	GATT	2	8	773	780	25 %	50 %	25 %	0 %	557606928
16	NC_022778	CTTT	2	8	784	791	0 %	75 %	0 %	25 %	557606928
17	NC_022778	ATT	3	9	810	818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606928
18	NC_022778	AAT	2	6	825	830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606928
19	NC_022778	GAAAT	2	10	833	842	60 %	20 %	20 %	0 %	557606928
20	NC_022778	ATT	2	6	852	857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606928
21	NC_022778	T	6	6	871	876	0 %	100 %	0 %	0 %	557606928
22	NC_022778	TA	3	6	887	892	50 %	50 %	0 %	0 %	557606928
23	NC_022778	ATA	3	9	923	931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606928
24	NC_022778	ATGA	2	8	932	939	50 %	25 %	25 %	0 %	557606928
25	NC_022778	A	7	7	1002	1008	100 %	0 %	0 %	0 %	557606929
26	NC_022778	ATT	2	6	1026	1031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606929
27	NC_022778	TATT	2	8	1051	1058	25 %	75 %	0 %	0 %	557606929
28	NC_022778	ATT	2	6	1120	1125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606929
29	NC_022778	TA	4	8	1127	1134	50 %	50 %	0 %	0 %	557606929
30	NC_022778	ATT	2	6	1140	1145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606929
31	NC_022778	T	6	6	1144	1149	0 %	100 %	0 %	0 %	557606929
32	NC_022778	AATT	2	8	1213	1220	50 %	50 %	0 %	0 %	557606930
33	NC_022778	T	8	8	1233	1240	0 %	100 %	0 %	0 %	557606930
34	NC_022778	CAA	2	6	1266	1271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557606930
35	NC_022778	TAA	3	9	1281	1289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606930
36	NC_022778	AAT	2	6	1294	1299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606930
37	NC_022778	AATTA	2	10	1314	1323	60 %	40 %	0 %	0 %	557606930
38	NC_022778	TAA	2	6	1356	1361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606930
39	NC_022778	TTA	2	6	1368	1373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606930
40	NC_022778	ATT	2	6	1528	1533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606931
41	NC_022778	AT	3	6	1543	1548	50 %	50 %	0 %	0 %	557606931
42	NC_022778	ATATT	2	10	1557	1566	40 %	60 %	0 %	0 %	557606931
43	NC_022778	A	6	6	1584	1589	100 %	0 %	0 %	0 %	557606931
44	NC_022778	TA	4	8	1590	1597	50 %	50 %	0 %	0 %	557606931
45	NC_022778	T	7	7	1598	1604	0 %	100 %	0 %	0 %	557606931
46	NC_022778	AAG	2	6	1624	1629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557606931
47	NC_022778	A	7	7	1631	1637	100 %	0 %	0 %	0 %	557606931
48	NC_022778	GGAA	2	8	1680	1687	50 %	0 %	50 %	0 %	557606931
49	NC_022778	TAA	2	6	1714	1719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606931
50	NC_022778	TTC	2	6	1750	1755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557606931
51	NC_022778	AGA	2	6	1795	1800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557606931
52	NC_022778	TAA	2	6	1803	1808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606931
53	NC_022778	AGA	2	6	1816	1821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557606931
54	NC_022778	AAT	2	6	1835	1840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606931
55	NC_022778	AT	3	6	1899	1904	50 %	50 %	0 %	0 %	557606932
56	NC_022778	TATT	2	8	1908	1915	25 %	75 %	0 %	0 %	557606932
57	NC_022778	TA	3	6	1932	1937	50 %	50 %	0 %	0 %	557606932
58	NC_022778	AAAT	2	8	1951	1958	75 %	25 %	0 %	0 %	557606932
59	NC_022778	AAT	2	6	2002	2007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606932
60	NC_022778	ATT	2	6	2014	2019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606932
61	NC_022778	CAT	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557606932
62	NC_022778	TAT	2	6	2118	2123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606933
63	NC_022778	AAG	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557606933
64	NC_022778	TAAAG	2	10	2151	2160	60 %	20 %	20 %	0 %	557606933
65	NC_022778	ATAC	2	8	2182	2189	50 %	25 %	0 %	25 %	557606933
66	NC_022778	AAT	2	6	2208	2213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606933
67	NC_022778	ATA	2	6	2281	2286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606933
68	NC_022778	TAA	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606933
69	NC_022778	AT	3	6	2315	2320	50 %	50 %	0 %	0 %	557606933
70	NC_022778	A	7	7	2425	2431	100 %	0 %	0 %	0 %	557606934
71	NC_022778	TGAA	2	8	2432	2439	50 %	25 %	25 %	0 %	557606934
72	NC_022778	AT	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	557606934
73	NC_022778	T	8	8	2494	2501	0 %	100 %	0 %	0 %	557606934
74	NC_022778	T	8	8	2539	2546	0 %	100 %	0 %	0 %	557606934
75	NC_022778	TTA	2	6	2549	2554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606934
76	NC_022778	TAG	2	6	2611	2616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557606934
77	NC_022778	TTAT	2	8	2794	2801	25 %	75 %	0 %	0 %	557606935
78	NC_022778	T	6	6	2835	2840	0 %	100 %	0 %	0 %	557606935
79	NC_022778	ATA	2	6	2875	2880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606935
80	NC_022778	TGT	2	6	2933	2938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557606935
81	NC_022778	AT	4	8	2983	2990	50 %	50 %	0 %	0 %	557606935
82	NC_022778	ACAA	2	8	3024	3031	75 %	0 %	0 %	25 %	557606935
83	NC_022778	TAA	2	6	3053	3058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606935
84	NC_022778	T	8	8	3076	3083	0 %	100 %	0 %	0 %	557606935
85	NC_022778	TGG	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557606935
86	NC_022778	T	6	6	3136	3141	0 %	100 %	0 %	0 %	557606935
87	NC_022778	ACCA	2	8	3148	3155	50 %	0 %	0 %	50 %	557606935
88	NC_022778	TGTA	2	8	3190	3197	25 %	50 %	25 %	0 %	557606935
89	NC_022778	GAAA	3	12	3220	3231	75 %	0 %	25 %	0 %	557606935
90	NC_022778	TAT	2	6	3456	3461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606936
91	NC_022778	AT	3	6	3460	3465	50 %	50 %	0 %	0 %	557606936
92	NC_022778	T	6	6	3467	3472	0 %	100 %	0 %	0 %	557606936
93	NC_022778	T	6	6	3489	3494	0 %	100 %	0 %	0 %	557606936
94	NC_022778	TAG	2	6	3538	3543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557606936
95	NC_022778	TA	3	6	3575	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	557606936
96	NC_022778	TAT	2	6	3590	3595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606936
97	NC_022778	AGA	2	6	3608	3613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557606936
98	NC_022778	TCT	2	6	3669	3674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557606936
99	NC_022778	TTTA	2	8	3698	3705	25 %	75 %	0 %	0 %	557606936
100	NC_022778	ATG	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557606936
101	NC_022778	ATT	2	6	3767	3772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606936
102	NC_022778	TTG	2	6	3825	3830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557606936
103	NC_022778	CTT	2	6	3907	3912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557606936
104	NC_022778	TAT	2	6	3938	3943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606936
105	NC_022778	T	6	6	3943	3948	0 %	100 %	0 %	0 %	557606936
106	NC_022778	ACC	2	6	4003	4008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557606937
107	NC_022778	TAG	2	6	4066	4071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557606937
108	NC_022778	ATT	2	6	4077	4082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606937
109	NC_022778	T	6	6	4081	4086	0 %	100 %	0 %	0 %	557606937
110	NC_022778	ATA	2	6	4119	4124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606937
111	NC_022778	TA	3	6	4172	4177	50 %	50 %	0 %	0 %	557606937
112	NC_022778	T	6	6	4182	4187	0 %	100 %	0 %	0 %	557606937
113	NC_022778	AATA	2	8	4188	4195	75 %	25 %	0 %	0 %	557606937
114	NC_022778	TCT	2	6	4198	4203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557606937
115	NC_022778	A	6	6	4222	4227	100 %	0 %	0 %	0 %	557606937
116	NC_022778	TTCAT	2	10	4231	4240	20 %	60 %	0 %	20 %	557606937
117	NC_022778	AATT	2	8	4250	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	557606937
118	NC_022778	TAT	2	6	4262	4267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606937
119	NC_022778	ATAATT	2	12	4308	4319	50 %	50 %	0 %	0 %	557606937
120	NC_022778	ACTT	2	8	4352	4359	25 %	50 %	0 %	25 %	557606937
121	NC_022778	T	7	7	4358	4364	0 %	100 %	0 %	0 %	557606937
122	NC_022778	T	7	7	4374	4380	0 %	100 %	0 %	0 %	557606937
123	NC_022778	TAAA	2	8	4388	4395	75 %	25 %	0 %	0 %	557606937
124	NC_022778	CTT	2	6	4406	4411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557606937
125	NC_022778	AAG	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557606937
126	NC_022778	TAG	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557606937
127	NC_022778	TAGCT	2	10	4518	4527	20 %	40 %	20 %	20 %	557606937
128	NC_022778	TTAC	2	8	4528	4535	25 %	50 %	0 %	25 %	557606937
129	NC_022778	CTAT	2	8	4871	4878	25 %	50 %	0 %	25 %	557606938
130	NC_022778	TGTT	2	8	4879	4886	0 %	75 %	25 %	0 %	557606938
131	NC_022778	TATT	2	8	4943	4950	25 %	75 %	0 %	0 %	557606938
132	NC_022778	T	7	7	4957	4963	0 %	100 %	0 %	0 %	557606938
133	NC_022778	AAT	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606938
134	NC_022778	ATC	2	6	5011	5016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557606938
135	NC_022778	ATT	2	6	5023	5028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557606938
136	NC_022778	CAA	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557606938
137	NC_022778	ATTTTT	2	12	5104	5115	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	557606938
138	NC_022778	AT	3	6	5132	5137	50 %	50 %	0 %	0 %	557606938
139	NC_022778	TAA	2	6	5171	5176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557606938
140	NC_022778	AGC	2	6	5182	5187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557606938
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